PHP和MySQL是Web开发中常用的两种技术，PHP是一种服务器端脚本语言，用于生成动态网页，而MySQL是一个关系型数据库管理系统，用于存储数据，将PHP和MySQL结合起来，可以创建功能强大的Web应用程序。
在PHP中，可以使用多种方法来连接和操作MySQL数据库，其中最常用的是mysqli和PDO扩展，以下是使用mysqli扩展连接和查询MySQL数据库的基本步骤：
1、创建MySQL数据库和用户，为用户分配权限，创建一个名为mydb的数据库和一个名为myuser的用户，然后给该用户分配对mydb的权限。
2、在PHP代码中，使用mysqli扩展的函数来连接MySQL数据库，需要创建一个新的mysqli对象，然后使用该对象的real_connect方法来连接数据库。
3、连接成功后，可以使用mysqli对象的query方法来执行SQL语句，要查询一个名为mytable的表中的所有记录，可以使用以下代码：
$sql = "SELECT * FROM mytable"; $result = $mysqli->query($sql);
4、执行查询后，可以使用mysqli_result对象的fetch_assoc方法来获取查询结果。
5、在获取查询结果后，可以按照需要对数据进行处理，例如显示在网页上或进行进一步的查询。
6、在完成数据库操作后，需要关闭数据库连接，释放资源。
在实际开发中，可能需要进行更复杂的数据库操作，如插入、更新和删除数据，还需要考虑安全性问题，如防止SQL注入攻击，为了提高代码的可读性和可维护性，建议使用面向对象的编程方法，并使用设计模式来组织代码。
常见问题与解答：
Q1: 如何防止SQL注入攻击？
A1: 防止SQL注入攻击的一个有效方法是使用预处理语句（PDO的预处理语句或mysqli的预处理语句），这样可以有效防止SQL注入攻击。
Q2: 如何优化数据库查询性能？
A2: 优化数据库查询性能的方法有很多，如使用索引、避免使用SELECT *、使用EXPLAIN关键字分析查询计划等。
Q3: 如何在PHP中使用事务？
A3: 在PHP中使用事务，可以使用mysqli的begin_transaction、commit和rollback方法，或者使用PDO的beginTransaction、commit和rollBack方法，在执行事务时，需要确保所有的数据库操作要么全部成功，要么全部失败。